Gabinet Dyrektora Generalnego i Współpracy z Zagranicą: Posiedzenia Kierownictwa Dyrekcji, Kolegium Przedsiębiorstwa Państwowego PKP, Zarządu PKP, Rady PKP, współpraca z ministerstwami i urzędami centralnymi, działalność Przedsiębiorstwa Państwowego PKP i Dyrekcji Generalnej PKP, protokoły, uchwały, informacje, wycinki prasowe, 1988-2000, sygn. 1/1-436, 2/1-178; Sekretariat Rady Techniczno-Ekonomicznej przy Dyrektorze generalnym PKP: Posiedzenia Rady, protokoły, 1988-2000, sygn. 1/437-451; Biuro Prawno-Organizacyjne: Podstawy prawne działania organizacja, restrukturyzacja, spory majątkowe, zarządzenia, przepisy, instrukcje, biuletyny, [1962-1986] 1987-2000, sygn. 1/452-612, 2/179-197; Biuro Informacji i Promocji: informacje, teki wydawnicze, 1998-2000, sygn. 1/613-625; Biuro Współpracy z Zagranicą,: sprawozdania, instrukcje, międzynarodowe umowy kolejowe, preliminarze wydatków przedsiębiorstw PKP za granicą, 1971-2000, sygn. 1/626-776, 2/198-331, 3/39-43; Zespół Kontroli, protokoły, skargi i wnioski, 1988-1999, sygn. 1/777-886; Biuro Spraw Pracowniczych i Socjalnych: plany, sprawozdania, skargi i wnioski, 1988-1996, sygn. 1/887-968; Biuro Polityki Personalnej: plany, opracowania, skargi i wnioski, protokoły Komisji Mieszkaniowej, 1990-2000, sygn. 1/969-1031, 4/39; Samodzielny Wydział ds. Socjalnych i Mieszkaniowych: analizy, skargi i wnioski, 1994-1998, sygn. 1/1032-1033; Ośrodek Organizacji i Normowania Pracy, wytyczne, taryfikator kwalifikacyjny, analiza, 1989-1993, sygn. 1/1034-1047; Biuro Trent i Emerytur: przepisy, skargi i wnioski, 1995-1998, sygn. 1/1048-1057; Wyższy Rzecznik Dyscyplinarny przy Dyrektorze Generalnym PKP: okólniki Min. Komunikacji, 1977-1989, sygn. 1/1058; Główny Inspektorat BHP:1991-2000, sygn. 1/1059-1061; Biuro Kształcenia i Doskonalenia Kadr: 1987-1997, sygn. 1/1062-1080; Naczelny Zarząd Kolejowej Służby Zdrowia: plany, analizy, 1985-1988, sygn. 1/1081-1084; Biuro Gospodarki Materiałowej: uchwały, zarządzenia Zarządu PKP, protokoły posiedzeń Komisji Racjonalizacji Druków, 1987-1999, sygn. 1/1085-1121; Komenda Główna Służby Ochrony Kolei, kontrole, ochrona obiektów, 1986-1992, sygn. 1/1122-1123; Biuro Ochrony Informacji Niejawnych, współpraca z ministerstwami i urzędami centralnymi, roczniki statystyczne, statystyka zatrudnienia i wynagrodzenia, statystyka pracy taboru, statystyka przewozu ładunków i pasażerów, 1977-1979, 1984, 1988-2000, sygn. 1/1124-1125, 3/49-223; Główny Inspektorat Ochrony Przeciwpożarowej, 1976-1995, sygn. 1/1126-1144; Biuro Administracyjne, 1993, sygn.1/ 1145; Biuro Analiz Ekonomicznych, zarządzenia, uchwały Zarządu PKP, plany rzeczowo-finansowe, analizy działalności, umowy wielostronne i dwustronne, 1989-2000, sygn. 1/1146-1183; Biuro Rachunkowości Finansowej, sprawozdania, rejestry, kontrole, 1985-2000, sygn. 1/1184-1189, 4/111-117; Biuro Strategii i Restrukturyzacji, 1996-1997, sygn. 1/1190; Biuro Strategii, 1997, 1999-2000, sygn. 1/1191-1193; Biuro Przekształceń Własnościowych i Restrukturyzacji, 1997-1999, sygn. 1/1194-1197; Biuro Inwestycji, Budownictwa i Techniki, plany, 1989-1995, sygn. 1/1198-1200; Biuro Przekształceń, Inwestycji Kapitałowych Prywatyzacji i Nadzoru Właścicielskiego, 1999-2000, sygn. 1/1201; Główny Inspektorat Ochrony Środowiska, kontrole, 1999-2000, sygn. 1/1202; Samodzielny Wydział Kolei Dojazdowych, likwidacja linii kolei dojazdowych, 1987-1988, sygn. 1/1203-1205; Naczelny Zarząd Automatyki, założenia techniczno-ekonomiczne, programy budowy, 1986-1995, sygn. 1/1206-1224; Główny Energetyk PKP, plany elektryfikacji kolei, akty normatywne, 1974-1990, sygn. 1/1225-1226; Naczelny Zarząd Taboru, decyzje Dyrektora, 1984-1990, sygn. 1/1227; Dyrekcja Trakcji i Zaplecza Warsztatowego, syntezy i programy rozwojowe, analizy, kontrole NIK, 1988-1996, sygn. 1/1228-1245; Naczelny Zarząd Taboru, przepisy, wytyczne, 1991-1995, sygn. 1/1246; Biuro Postępu Technicznego i Rozwoju Taboru oraz Zaplecza Warsztatowego, protokoły posiedzeń Komisji Wynalazczości, analizy, oceny, opinie, 1988-1992, sygn. 1/1247-1255; Naczelny Zarząd Przewozów, protokoły posiedzeń Rady Wspólnego Parku Wagonów, plany, analizy1986-1990, sygn. 1/1256-1268; Naczelny Zarząd Ruchu Kolejowego, przepisy, instrukcje, regulaminy, wystawy, 1987-1995, sygn. 1/1269-1285; Główny Inspektorat Bezpieczeństwa Ruchu Kolejowego, 1981-2000, sygn. 1/1287-1292; Naczelne Biuro Handlowe Towarowe, plany, protokoły, Dzienniki Taryf i Zarządzeń Komunikacyjnych, instrukcje, sprawozdania, przepisy, 1988-1998, sygn. 1/1293-1303; Naczelny Zarząd Utrzymania Kolei, plany, sprawozdania, normalizacje, opinie, 1987-1993, sygn. 2/332-339; Kolegium PKP: nagrania z posiedzeń, 1995, sygn. 3/1-3; Rada PKP: nagrania z posiedzeń Rady, 1998-2000, sygn. 3/4-14; Członek Zarządu ds. Restrukturyzacji: koncepcje, programy, teki wydawnicze, 2000, sygn. 3/15-16; Biuro Zarządu: skargi i wnioski, współpraca z ministerstwami i urzędami centralnymi, rejestr uchwał Zarządu, współpraca z partiami politycznymi i organizacjami społecznymi - porozumienia, uchwały, protokoły, oświadczenia, 1996-2000, sygn. 3/17-38, 4/28-38; Generalne Przedstawicielstwo DG PKP w Niemczech: udział w konferencjach, sympozjach, seminariach, naradach, sprawozdania z działalności, 1998-1999, sygn. 3/44-45; Przedstawicielstwo DG PKP w Republice Czeskiej: organizacja przewozów, programowanie wielkości standardów przewozowych, 1996, 1998, 2000, sygn. 3/46-48; Gabinet Zarządu: uchwały Zarządu, decyzje Prezesa, 1999-2000, sygn. 4/1-27; Biuro Administracyjno-Gospodarcze, wzory odciskowe pieczęci - rejestr, 1993-2000, sygn. 4/40; Biuro Szkolenia, Kadr i Kontroli Terenowa Grupa Rewizyjna Nr 1: protokoły kontroli, zalecenia pokontrolne, 1988-1990, sygn. 4/41-108; Biuro Inwestycji: skargi i wnioski, 1998-1999, sygn. 4/109-110; Biuro Finansów i Rachunkowości: sprawozdania finansowe, , protokoły kontroli, system ewidencji i plan kont, 1996-2001, sygn. 4/118-142; Biuro Planowania i Ekonomiki: sprawozdania, 2000, sygn. 4/143; Generalne Przedstawicielstwo PKP w Austrii z siedzibą w Wiedniu: sprawozdania z działalności, 1992-2000, sygn. 4/145.

Dyrekcja Generalna Przedsiębiorstwa PKP jako wyodrębniona instytucja działa od 1987 r. ( Dz. U. Nr 33, poz.180) i była aparatem wykonawczym Przedsiębiorstwa Państwowego Polskie Koleje Państwowe i podlegała Ministerstwu Transportu i Gospodarki Morskiej. Dyrekcja Generalna działa na podstawie ustawy z 6 lipca 1995 r. W latach 1977-1987, Dyrekcja Generalna Przedsiębiorstwa PKP działała w Ministerstwie Komunikacji, a funkcję jej dyrektora sprawował Minister Komunikacji. Od 01.01.2001 r. Dyrekcja Generalna PKP przekształciła się w spółkę Polskie Koleje Państwowe Spółka Akcyjna (Skarbu Państwa) na podstawie ustawy z dnia 08.09.2000 r.